A toxicidade química é a mesma da amônia convencional:

A amônia verde ainda é quimicamente NH₃. É irritante e altamente corrosivo/irritante para o trato respiratório, olhos e pele. A inalação de altas concentrações pode causar danos respiratórios graves ou até mesmo a morte. Também é tóxico para corpos d'água (nocivo a organismos aquáticos). Portanto, Os procedimentos de segurança para manuseio, transporte e armazenamento de amônia verde são exatamente os mesmos que para a amônia convencional e são extremamente importantes.

Amônia verde ≠ amônia inofensiva — É simplesmente amônia produzida por meio de processos com emissão zero de carbono.